Analiza pokrewieństwa genetycznego szczepów C. glabrata opornych na leki z grupy azoli wyizolowanych z materiałów klinicznych chorych hospitalizowanych w Samodzielnym Publicznym Centralnym Szpitalu Klinicznym

Emilia Tsimbalari¹, *Beata Sulik-Tyszka², Marlena Gołaś^{2, 3}, Magdalena Sikora⁴, Katarzyna Piskorska^{2, 3}, Ewa Swoboda-Kopeć^{2, 3}

Streszczenie
Wstęp. W ostatnich latach odnotowano znaczący postęp w diagnostyce zakażeń grzybiczych spowodowany przede wszystkim opracowaniem nowych metod diagnostycznych oraz wprowadzeniem metod opartych na biologii molekularnej. Metody te są stosowane zarówno do diagnostyki, jak i badań epidemiologicznych. Jedną z ostatnich modyfikacji metody genetycznej RAPD PCR jest PCR melting profile. Metoda ta posiada wyższy potencjał różnicujący, w porównaniu z metodą RAPD PCR, dzięki wystandaryzowaniu poszczególnych etapów reakcji.
Cel pracy. Analiza pokrewieństwa gentycznego szczepów C. glabrata opornych na leki z grupy azoli wyizolowanych z materiałów klinicznych chorych hospitalizowanych w Samodzielnym Publicznym Centralnym Szpitalu Klinicznym (SPCSK) w Warszawie.
Materiał i metody. Analizie poddano 54 szczepy C. glabrata wykazujące oporność na leki z grupy azoli. Szczepy zostały wyizolowane z różnych materiałów klinicznych od chorych z zakażeniem inwazyjnym zgodnie z zasadami klasycznej diagnostyki mikologicznej. Badanie pokrewieństwa genetycznego wykonano używając komercyjnego zestawy PCR MP.
Wyniki. Dla 54 szczepów C. glabrata wykonano analizę ich pokrewieństwa genetycznego. Na podstawie porównania wzorów prążkowych wyodrębniono 38 różnych typów genetycznych. Od dwóch chorych wyizolowano szczepy C. glabarata o tym samym wzorze prążkowym.
Wnioski. Duże zróżnicowanie wyizolowanych szczepów może świadczyć o endogennym charakterze większości zakażeń i wyklucza możliwość klonalnego rozprzestrzeniania się szczepów C. glabrata w środowisku szpitalnym.

Summary
Introduction. In the last years there has been significant progress in the diagnostics of fungal infections which is associated with the development of new diagnostic methods and the development of methods based on molecular biology. These methods are used for both, diagnostic and epidemiological studies. One of the last modification of the RAPD method is PCR melting profile, this method differentiate microorganisms at the same level or even better than the RAPD.
Aim. Genetic relatedness analysis of C. glabrata strains resistant to azoles isolated from clinical samples patients hospitalized in the Central Clinical Hospital in Warsaw.
Material and methods. 54 strains of C. glabrata resistant to azoles were analyzed. The strains were isolated from various clinical materials patients with invasive infections in accordance using rutine mycological techniques. The study of genetic relatedness was performed using a commercial PCR MP kits.
Results. Fifty-four strains of C. glabrata strains were for genetic relatedness. On the basis of bands patterns 38 different genetic types were identified. In one case, from two patients were isolated C. glabrata strains with the same band patterns.
Conclusions. High diversity of C. glabrata strains may be indicative of an endogenous nature of most infections and rule out the possibility of clonal spread of strains in a hospital environment.

To jest tylko fragment artykułu. Aby przeczytać całość, przejdź do Czytelni medycznej.